总体而言，购物中心经营业态，百货经营商品。具体从以下几方面进行区分：
首先，业态构成不同
    百货店是在封闭环境市场内，实行统一管理的“单体楼”为便利顾客选购提供必要服务的零售业态；购物中心是多业态多业种复合，体现“一站式消费”的多功能大型商用物业，一般是统一规划的建筑集群，集购物、休闲、娱乐、餐饮等多种商业功能于一体。
其次，功能不同
    百货商城只是一个购物场所，服务特定商圈的百货商品选购者；购物中心是集中众多商业资源的商业地产项目。
再次，获利方式不同
    百货商城主要通过专柜销售收入的分成方式获利；购物中心主要通过分租物业的租金收入方式获利。
又再次，运营管理不同
    百货运营管理的重点是商品组合和促销，以联营专柜经营为主，采取柜台销售和开架面售相结合方式，通过统一收银，实施进、销、结、存管理；
购物中心运营管理的重点是业态组合的配置和租户管理的效果，并以经营租户为主，通过物业、商务的统一管理。购物中心里可以包括一家，甚至多家百货店。
最后，布局模式不同
    百货商城以商品岛方式布局，只在有限的场内共享空间；购物中心多以数条步行街或回廊式多层布局，其共享空间通透各业态的聚集和互动，能扩展到周边环境。
百货商场商铺的特点
    百货商场商铺多采用专卖店的形式，空间上相对独立；部分是采取柜台的方式；大部分采取开放空间内专卖区的形式，各个品牌销售区只通过地块的划分有所区别。百货商场铺位绝大多数采用出租或按照营业额流水提成的方式，也有些采取租金和流水提成结合的方式。
购物中心商铺的特点
    购物中心经营商基本以主力店作为购物中心重要的组成部分。里面的商铺主要采取出租的方式，有些运营商会采取按照经营流水提成的方式，或者采取租金和提成、结合的方式。